Fluorescentie In situ hybridisatie
Fluorescentie in situ hybridisatie (FISH) is een van de vele technieken die worden gebruikt om het DNA van uw cellen te doorzoeken, op zoek naar de aanwezigheid of afwezigheid van specifieke genen of delen van genen.
Veel verschillende soorten kanker zijn geassocieerd met bekende genetische afwijkingen. En door genetisch te praten, hebben we het niet alleen over erfelijkheid. Een leven lang kunnen cellen fouten maken wanneer ze delen en groeien.
Mutaties in het DNA die geassocieerd zijn met kanker kunnen zich in deze cellen ophopen.
Hoe werkt FISH?
FISH is een techniek die fluorescente sondes gebruikt om specifieke genen of delen van genen (DNA-sequenties) te detecteren. Medewerkers van het medisch centrum en oncologen gebruiken VIS om patiënten te helpen beoordelen die mogelijk kanker hebben en soms om een patiënt te controleren die al met kanker is gediagnosticeerd en behandeld.
FISH kan worden gedaan met behulp van verschillende soorten monsters, afhankelijk van de locatie en het type kanker dat wordt vermoed: tumorcellen verkregen uit perifeer bloed, uit een biopsie van het beenmerg of uit een biopsie van de lymfklier, en formaline gefixeerd in paraffine ingebed weefsel (dit verwijst naar een weefselmonster dat in het laboratorium wordt verwerkt en in een soort was wordt ingebed, waardoor het meer stijf wordt, zodat het in dunne secties kan worden gesneden en onder de microscoop kan worden bekeken).
Wat betekenen de letters?
De "H" in FISH verwijst naar hybridisatie.
Bij moleculaire hybridisatie wordt een gelabelde DNA- of RNA-sequentie als een probe gebruikt - visualiseer een rode Lego-steen, als je wilt. De probe wordt gebruikt om een tegenhanger van Lego-baksteen of DNA-sequentie te vinden in een biologisch monster.
DNA in je exemplaar is als stapels Legoblokjes en de meeste stenen in deze stapels komen niet overeen met onze rode sonde.
En al je stenen zijn netjes georganiseerd in 23 paar stenen stapels - elke stapel is min of meer een van je gekoppelde homologe chromosomen. In tegenstelling tot Legoblokjes, is onze rode Lego-sonde als een sterke magneet en vindt deze zijn gelijke zonder door de palen te hoeven sorteren.
De "F" verwijst naar fluorescentie. Onze rode sonde kan verloren raken in de stapels stenen, dus het is gelabeld met gekleurde fluorescerende verf zodat deze zal gloeien. Wanneer het zijn overeenkomst tussen de 23 gepaarde palen vindt, onthult een fluorescerend label zijn locatie. U kunt dus nu zien hoe onderzoekers en clinici met FISH kunnen helpen identificeren waar (welke pool, of welk chromosoom) een bepaald gen zich bevindt voor een bepaald individu.
De "I" en de "S" staan voor in situ . Dit verwijst naar het feit dat onze rode Lego-steen zoekt naar zijn match binnen de sample die je gaf .
Hoe zit het met specifieke bloedkankers?
FISH en andere in situ hybridisatieprocedures worden gebruikt om een verscheidenheid aan chromosomale afwijkingen te diagnosticeren: veranderingen in het genetische materiaal, veranderingen in chromosomen, waaronder:
Deletie - een deel van een chromosoom is verdwenen
Translocatie - een deel van een chromosoom breekt af en blijft plakken op een ander chromosoom
Inversie - een deel van een chromosoom breekt af en komt weer terug, maar in omgekeerde volgorde
Duplicatie - een deel van een chromosoom is in te veel exemplaren aanwezig in de cel
Elk type kanker kan zijn eigen set van chromosomale veranderingen en relevante sondes hebben. FISH helpt niet alleen bij het identificeren van de initiële genetische veranderingen in een ziekteproces zoals kanker, maar het kan ook worden gebruikt om de respons op therapie en remissie van de ziekte te volgen.
De genetische veranderingen die door FISH worden gedetecteerd, bieden soms aanvullende informatie over hoe de kanker van een individu zich waarschijnlijk zal gedragen, gebaseerd op wat in het verleden is waargenomen bij mensen met dezelfde soort kanker en soortgelijke genetische veranderingen. Soms wordt FISH gebruikt nadat de diagnose al is gesteld, om aanvullende informatie te verzamelen die kan helpen de uitkomst of de beste behandeling van een patiënt te voorspellen.
FISH kan chromosomale afwijkingen in leukemieën identificeren, waaronder chronische lymfatische leukemie (CLL). Voor chronische lymfatische leukemie / klein lymfocytair lymfoom stelt FISH patiënten in staat hun prognostische categorie te bepalen: goed, gemiddeld of slecht. Bij acute lymfoblastische leukemie (ALL) kan de genetica van de leukemiecellen u vertellen over het risiconiveau van kanker en helpen bij het begeleiden van therapeutische beslissingen.
FISH-panels zijn ook beschikbaar voor lymfoom, multipel myeloom, plasmaproproliferatieve aandoeningen en myelodysplastisch syndroom. In het geval van mantelcellymfoom is er bijvoorbeeld een translocatie die FISH kan detecteren, genaamd GH / CCND1 t (11; 14) die vaak wordt geassocieerd met dit lymfoom.
Waarom vissen?
Een voordeel van FISH is dat het niet hoeft te worden uitgevoerd op cellen die zich actief delen. Cytogenetische tests duren meestal ongeveer drie weken, omdat de kankercellen ongeveer 2 weken in laboratoriumschalen moeten groeien voordat ze kunnen worden getest. FISH-resultaten zijn daarentegen meestal binnen een paar dagen verkrijgbaar bij het laboratorium.
> Bronnen:
> Kanker Cytogenetische testen van CPT-codes.
> Fluorescentie in situ hybridisatie (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescentie in situ hybridisatie (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, et al. Richtlijn voor fluorescentie in situ hybridiseringstesten bij hematologische aandoeningen. The Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007; 9 (2): 134-143.